Son los años 40. En un pequeño pueblo de California vive Pepper Flint Busbee, un niño de 8 años apodado 'Little Boy', debido a su baja estatura. El niño es constantemente acosado por sus compañeros de clase pero a él no le molesta ser más bajo, porque se siente feliz teniendo a su padre a su lado. Cuando le dan la noticia de que su padre ha sido capturado y hecho prisionero durante la Segunda Guerra Mundial, con la ayuda de su madre, el sacerdote del pueblo y un viejo mecánico japonés, el mantiene la esperanza que regresará cuando termine la guerra.